สำหรับการเลือกใช้งานเครื่องพิมพ์บาร์โค้ดนั้นทางเจ้าของธุรกิจจะต้องทำความเข้าใจให้ชัดเจนถึงขนาดและประเภทการใช้งานของเครื่องพิมพ์บาร์โค้ด เช่น หากเป็นอุตสาหกรรมขนาดเล็กก็ไม่จำเป็นต้องใช้เครื่องที่มีราคาแพงหรือใหญ่จนเกินไป โดยเครื่องพิมพ์บาร์โค้ดจะแบ่งออกเป็น 2 ประเภทใหญ่ๆ คือ 

1. ระบบพิมพ์ผ่านผ้าหมึก (Thermal Transfer) คือระบบการพิมพ์ที่ต้องอาศัยผ้าหมึกในการพิมพ์ โดยตัวเครื่องพิมพ์บาร์โค้ดจะส่งความร้อนไปยังหัวพิมพ์เพื่อละลายหมึกริบบอนบนผ้าหมึกให้ติดกับสติ๊กเกอร์ที่ต้องการ ซึ่งผ้าหมึกที่เราใช้กับเครื่องพิมพ์บาร์โค้ด เรียกว่า หมึกริบบอน (Ribbon) ข้อดีของระบบ Thermal Transfer คือ หมึกพิมพ์มีความคงทน สีไม่ซีด อยู่ได้นาน แต่เครื่องพิมพ์แบบนี้คุณจะต้องคอยเปลี่ยน หมึกริบบอน (Ribbon) อยู่เสมอ

2. ระบบพิมพ์โดยตรง (Direct Thermal) คือระบบการพิมพ์โดยไม่ต้องใช้หมึกริบบอน โดยตัวเครื่องพิมพ์จะส่งความร้อนไปยังหัวพิมพ์และสัมผัสกับตัวสติ๊กเกอร์โดยตรง ระบบการพิมพ์โดยตรงนั้นจะต้องใช้สติ๊กเกอร์สำหรับระบบนี้โดยเฉพาะ เนื่องจากผิวหน้าของสติ๊กเกอร์มีการเคลือบสารเคมีเอาไว้ เมื่อโดนความร้อนจากเครื่องพิมพ์บาร์โค้ดแบบ Direct Thermal ในส่วนที่โดนความร้อนจะเปลี่ยนเป็นสีดำ สำหรับข้อดีของระบบ Direct Thermal คือ ช่วยให้คุณสามารถตัดปัญหาที่เกิดจาก ริบบอนบาร์โค้ด ทิ้งไปได้เลย ไม่ต้องคอยเปลี่ยน แต่ฉลากบาร์โค้ดนั้นก็จะมีอายุการเก็บรักษาไว้ไม่ได้นาน สารเคมีที่เคลือบอยู่จะสลายไปเองตามธรรมชาติ และไม่ทนต่อรอยขีดข่วน เช่น ฉลากยา ใบเสร็จค่าน้ำ ใบเสร็จค่าไฟ

โดยทั่วไปแล้วประเภทของเครื่องพิมพ์บาร์โค้ดนั้น จะแบ่งออกเป็น 3 ประเภท ตามลักษณะของการใช้งาน คือ Desktop Printer, Mid-Rang Printer, Industrial Printer